More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3062 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3062  transposase  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  97 
 
 		 405 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0013  ISGsu3, transposase  60.34 
 
 		 116 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0180659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0247  ISGsu3, transposase  60.34 
 
 		 116 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.425976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2499  ISGsu3, transposase  60.34 
 
 		 116 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  64.36 
 
 		 369 aa  141  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  64.36 
 
 		 369 aa  141  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  64.36 
 
 		 369 aa  141  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  64 
 
 		 369 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1690  ISGsu2, transposase  64 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0288166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1376  ISGsu2, transposase  64 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4641  transposase, IS4  61.54 
 
 		 222 aa  131  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.395706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 		 368 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1266  transposase, IS4  61 
 
 		 340 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  59.62 
 
 		 365 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  60.4 
 
 		 365 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  58.65 
 
 		 366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  58.65 
 
 		 366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  58.65 
 
 		 366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  58.65 
 
 		 366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  58.25 
 
 		 366 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  59.41 
 
 		 366 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  57.69 
 
 		 367 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6786  transposase IS4 family protein  55.34 
 
 		 368 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  54.81 
 
 		 368 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  54.81 
 
 		 368 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  55.77 
 
 		 368 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2513  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2694  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00558684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3116  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000441936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0006  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0155  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0839  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000787198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0440  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2311  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000514015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1681  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  52 
 
 		 361 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  52 
 
 		 361 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  52 
 
 		 361 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  58 
 
 		 364 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  58.42 
 
 		 366 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0096  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0227  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0751226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0307  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0723  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.619399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0980  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1090  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1312  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1514  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1517  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1580  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1956  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2178  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2511  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2556  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2687  prophage LambdaMc01, ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.765288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2810  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2964  ISMca1, transposase  61 
 
 		 366 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3918  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3613  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3410  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3331  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2685  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2122  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.973511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0222  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1337  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0686  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.278758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2015  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0089  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0576  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0868679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0754  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0806  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1230  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1431  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1519  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1871  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1916  transposase, IS4 family protein  60 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>