132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2609 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2609  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  408  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.763724  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2611  hypothetical protein  95.97 
 
 
148 aa  231  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  73.6 
 
 
366 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  73.6 
 
 
366 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0283  transposase IS4  54.4 
 
 
358 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1069  transposase IS4  54.4 
 
 
358 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0456377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2091  transposase IS4  54.4 
 
 
358 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000396436  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2240  transposase IS4  54.4 
 
 
358 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000126004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2488  transposase IS4  54.4 
 
 
358 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2883  transposase IS4  54.4 
 
 
358 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3283  transposase IS4  54.4 
 
 
337 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  50.78 
 
 
364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0839  transposase IS4 family protein  51.59 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000787198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0006  transposase IS4 family protein  51.59 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0014  transposase, IS4  54.4 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0462942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0246  transposase, IS4  54.4 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.261546  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1681  transposase IS4 family protein  51.59 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0155  transposase IS4 family protein  51.59 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193829  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2500  transposase, IS4  54.4 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  54.4 
 
 
369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2513  transposase IS4 family protein  51.59 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3116  transposase IS4 family protein  51.59 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000441936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2694  transposase IS4 family protein  51.59 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00558684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2311  transposase IS4 family protein  51.59 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000514015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0440  transposase IS4 family protein  51.59 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  47.62 
 
 
361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  47.62 
 
 
361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  47.62 
 
 
361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  53.66 
 
 
369 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  53.66 
 
 
369 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  53.66 
 
 
369 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0096  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0227  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0751226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0307  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0723  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.619399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0980  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1090  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1312  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1514  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1517  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1580  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1956  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2178  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2511  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2556  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2687  prophage LambdaMc01, ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.765288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2810  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2964  ISMca1, transposase  50 
 
 
366 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3889  transposase, IS4  49.59 
 
 
367 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  49.59 
 
 
367 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  49.59 
 
 
367 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  49.59 
 
 
367 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1112  transposase, IS4  49.59 
 
 
367 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2726  transposase, IS4  49.59 
 
 
367 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0495453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3098  transposase, IS4  49.59 
 
 
367 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3687  transposase, IS4  49.59 
 
 
367 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3700  transposase, IS4  49.59 
 
 
367 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2594  transposase, IS4  49.59 
 
 
367 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2894  transposase, IS4 family protein  49.59 
 
 
367 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5505  transposase, IS4 family protein  49.59 
 
 
367 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60603  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5960  transposase, IS4 family protein  49.59 
 
 
367 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6302  transposase, IS4 family protein  49.59 
 
 
367 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0089  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0576  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0868679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0754  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0806  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1230  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1431  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1519  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1871  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1916  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176419  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2122  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.973511  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2685  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3331  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3410  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3613  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3918  transposase, IS4 family protein  47.93 
 
 
362 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>