51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4713 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4713    100 
 
 		 1102 bp  2185    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0412243  normal  0.806779 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4484  transposase, IS4 family protein  89.64 
 
 		 435 bp  392  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.604726  hitchhiker  0.00217113 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  84.89 
 
 		 1107 bp  176  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  78.5 
 
 		 1101 bp  149  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  80.74 
 
 		 1104 bp  135  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  78.4 
 
 		 1101 bp  125  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  78.4 
 
 		 1101 bp  125  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  78.4 
 
 		 1101 bp  125  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  78.4 
 
 		 1101 bp  125  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0409  transposase, IS4  85.62 
 
 		 168 bp  123  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00514  putative ISXoo14 transposase  83.82 
 
 		 1002 bp  121  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  83.82 
 
 		 1098 bp  121  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02785  putative ISXoo14 transposase  84.38 
 
 		 1110 bp  119  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4641  transposase, IS4  80.08 
 
 		 669 bp  103  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.395706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03799    82.09 
 
 		 663 bp  75.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  80.99 
 
 		 1110 bp  67.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  80.99 
 
 		 1110 bp  67.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  83.67 
 
 		 1218 bp  67.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  80.99 
 
 		 1110 bp  67.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1813    84.81 
 
 		 510 bp  61.9  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02389    87.5 
 
 		 240 bp  56  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  85.14 
 
 		 1107 bp  54  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3062  transposase  82.83 
 
 		 561 bp  54  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  85.51 
 
 		 1107 bp  52  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0529    86.79 
 
 		 723 bp  50.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117782 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  85.07 
 
 		 1107 bp  48.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0222  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0686  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.278758  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5975    93.75 
 
 		 895 bp  48.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100438  normal  0.316362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1336    100 
 
 		 3842 bp  48.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1337  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2015  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2124  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1098 bp  48.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.436654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1916  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0089  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0576  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0868679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0754  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0806  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1230  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1431  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1519  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1871  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3918  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2122  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.973511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2685  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3331  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3410  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3613  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1089 bp  48.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>