176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4484 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4484  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 144 aa  293  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.604726  hitchhiker  0.00217113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  81.65 
 
 		 366 aa  189  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  81.65 
 
 		 366 aa  189  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  81.65 
 
 		 366 aa  189  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  81.65 
 
 		 366 aa  189  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  85.71 
 
 		 367 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  79.82 
 
 		 366 aa  185  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  80 
 
 		 368 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  73.15 
 
 		 365 aa  165  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00514  putative ISXoo14 transposase  71.82 
 
 		 333 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02785  putative ISXoo14 transposase  71.3 
 
 		 369 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  53.68 
 
 		 368 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  53.68 
 
 		 368 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6786  transposase IS4 family protein  56.1 
 
 		 368 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  59.62 
 
 		 368 aa  123  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  47.62 
 
 		 361 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  47.62 
 
 		 361 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  47.62 
 
 		 361 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0283  transposase IS4  44.19 
 
 		 358 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1069  transposase IS4  44.19 
 
 		 358 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0456377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2091  transposase IS4  44.19 
 
 		 358 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000396436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2240  transposase IS4  44.19 
 
 		 358 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000126004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2488  transposase IS4  44.19 
 
 		 358 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2883  transposase IS4  44.19 
 
 		 358 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0155  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0440  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0006  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2513  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0839  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000787198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3116  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000441936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2694  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00558684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2311  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000514015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1681  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330564  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3131  transposase, IS4  53.64 
 
 		 367 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347053  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5376  transposase, IS4  53.64 
 
 		 367 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3700  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3889  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1527  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.717674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2279  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2594  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5596  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2894  transposase, IS4 family protein  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5505  transposase, IS4 family protein  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5960  transposase, IS4 family protein  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6302  transposase, IS4 family protein  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2770  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2726  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0495453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3687  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3098  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1112  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0987  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3984  transposase, IS4  56 
 
 		 367 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 365 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2772  ISGsu3, transposase  42.15 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  48.57 
 
 		 366 aa  95.9  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  48.57 
 
 		 366 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0096  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0227  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0751226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0307  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0723  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.619399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0980  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1090  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1312  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1514  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1517  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1580  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1956  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2178  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2511  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2556  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2687  prophage LambdaMc01, ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.765288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2810  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2964  ISMca1, transposase  41.67 
 
 		 366 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3283  transposase IS4  42.73 
 
 		 337 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0222  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2015  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1337  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0686  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.278758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0754  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0576  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0868679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1519  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1431  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1916  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2685  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2122  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.973511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1871  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1230  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3410  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3331  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3918  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3613  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0806  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0089  transposase, IS4 family protein  44.55 
 
 		 362 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1692  transposase, IS4  41.82 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>