20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8276 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8276  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  241  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8016  Ku protein  100 
 
 		 273 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0632763  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6966  Ku protein  70.27 
 
 		 275 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7048  Ku protein  61.33 
 
 		 270 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2434  Ku domain-containing protein  49.23 
 
 		 264 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.109903 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5141  Ku protein  58.67 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2175  Ku domain-containing protein  50.77 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0621113  decreased coverage  0.00931596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1151  Ku domain-containing protein  43.01 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4362  Ku family containing protein  43.24 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2240  Ku protein  42.03 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.986714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0383  Ku protein  51.35 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0523  hypothetical protein  52.31 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1427  Ku family containing protein  39.74 
 
 		 271 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  hitchhiker  0.00131417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0306  Ku protein  43.66 
 
 		 268 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1735  Ku protein  44.62 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4314  Ku family containing protein  45.59 
 
 		 266 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0275  Ku protein  44.29 
 
 		 267 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4302  Ku family containing protein  31.58 
 
 		 299 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.551773  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3871  hypothetical protein  30.99 
 
 		 312 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3065  hypothetical protein  36.36 
 
 		 321 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.012759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>