33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1264 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1264  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 686 aa  1395    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03680  conserved repeat protein  54.63 
 
 		 693 aa  681    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.158433  normal  0.0107502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  40.45 
 
 		 1857 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  39.33 
 
 		 2113 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  39.33 
 
 		 2520 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  39.08 
 
 		 2121 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  36.9 
 
 		 898 aa  51.2  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  40.66 
 
 		 2520 aa  51.2  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  38.2 
 
 		 1533 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  33.33 
 
 		 909 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  28.66 
 
 		 440 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  34.78 
 
 		 543 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  35.29 
 
 		 2490 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  36.27 
 
 		 2485 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  35.64 
 
 		 2358 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  37.62 
 
 		 1118 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  35.64 
 
 		 2358 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1202 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  33.98 
 
 		 5010 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  35.64 
 
 		 2490 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  35.64 
 
 		 2490 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  29.91 
 
 		 5010 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4228  conserved repeat domain protein  28.79 
 
 		 2395 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.687969 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  34.31 
 
 		 2490 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1898 aa  45.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  36.04 
 
 		 599 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  34.31 
 
 		 2487 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  33.76 
 
 		 2853 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  39.13 
 
 		 2490 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  34.31 
 
 		 2490 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  40.45 
 
 		 775 aa  44.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0060  hypothetical protein  37.18 
 
 		 468 aa  44.3  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0938  hypothetical protein  25.93 
 
 		 586 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000915423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>