19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3971 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3971  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 495 aa  906    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  25.78 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1441  pyrrolo-quinoline quinone  31.53 
 
 		 666 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  25.57 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  31.68 
 
 		 475 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  30.28 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  25.97 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.34 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2069  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  29.7 
 
 		 407 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.95 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  29.73 
 
 		 397 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  25.73 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  28.25 
 
 		 365 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  28.93 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  44.07 
 
 		 380 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  42.19 
 
 		 380 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  29.95 
 
 		 385 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  42.19 
 
 		 380 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  45.61 
 
 		 389 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>