More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0734 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0734  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  100 
 
 
164 aa  329  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31430  O-6-methylguanine DNA methyltransferase  67.48 
 
 
170 aa  201  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3109  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  63.8 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1071  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  53.66 
 
 
179 aa  160  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1011  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  57.67 
 
 
173 aa  157  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3396  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  52.87 
 
 
186 aa  157  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.923616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1506  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  54.6 
 
 
164 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.565536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1507  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  52.76 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000320146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3181  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  52.94 
 
 
186 aa  138  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4164  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  56.6 
 
 
170 aa  137  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3784  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  55.76 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7757  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  45.91 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2104  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  33.94 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1945  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  33.94 
 
 
172 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1834  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  33.94 
 
 
172 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2292  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  33.94 
 
 
172 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4134  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  42.86 
 
 
184 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2581  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  32.12 
 
 
198 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2397  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  33.13 
 
 
177 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1031  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  38.18 
 
 
204 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1028  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  37.58 
 
 
204 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1536  transcriptional regulator, AraC family  52.27 
 
 
366 aa  96.3  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.26366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4734  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  53.41 
 
 
240 aa  95.5  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0082  ada regulatory protein  51.14 
 
 
354 aa  95.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2082  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  30.3 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0390601  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0476  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  51.14 
 
 
361 aa  94.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2938  AraC family transcriptional regulator  50.56 
 
 
357 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0793  transcriptional regulator, AraC family  54.02 
 
 
376 aa  94.4  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0138198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1325  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  46.94 
 
 
175 aa  94.4  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02140  fused DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  49.43 
 
 
354 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1445  transcriptional regulator, AraC family  49.43 
 
 
354 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.29559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1437  AraC family transcriptional regulator  49.43 
 
 
354 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02099  hypothetical protein  49.43 
 
 
354 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.592554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2512  regulatory protein Ada  48.86 
 
 
354 aa  94  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0107303  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2362  regulatory protein Ada  49.43 
 
 
354 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960218  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2352  regulatory protein Ada  49.43 
 
 
354 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.970088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0727  regulatory protein Ada  49.43 
 
 
354 aa  93.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.166972  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2798  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  35.4 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3765  bifunctional DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  52.27 
 
 
354 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3351  regulatory protein Ada  49.43 
 
 
354 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.212963  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2422  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  35.4 
 
 
178 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0173475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4134  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
354 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0607807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3191  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  37.2 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00040761  hitchhiker  0.000000000547074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  52.27 
 
 
358 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  52.27 
 
 
358 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320795  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4931  AraC family transcriptional regulator  51.14 
 
 
354 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4482  AraC family transcriptional regulator  35.93 
 
 
401 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221745  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0383  ada regulatory protein  52.27 
 
 
361 aa  91.3  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0368  ada regulatory protein  52.27 
 
 
361 aa  91.3  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1027  transcriptional regulator, AraC family  48.28 
 
 
359 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0706  adaptive response regulator protein  52.87 
 
 
350 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998073  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3365  methylated-DNA-[protein]-cysteine S-methyltransferase  48.28 
 
 
384 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2793  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  39.73 
 
 
354 aa  90.9  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.986339  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0739  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  52.87 
 
 
350 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0740  AraC family transcriptional regulator  52.87 
 
 
350 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2570  bifunctional methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase/O-6-methylguanine-DNA transcription regulator  50 
 
 
360 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3595  Ada regulatory protein  47.13 
 
 
368 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4074  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  34.42 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3955  transcriptional regulator, AraC family  48.86 
 
 
391 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000156521  normal  0.830157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1865  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  30.3 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2309  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  28.92 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.429468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2290  O-6-alkylguanine-DNA:cysteine-protein methyltransferase  28.92 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1787  O-6-alkylguanine-DNA:cysteine-protein methyltransferase  28.92 
 
 
171 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4239  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  49.44 
 
 
353 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.577797  normal  0.120321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01312  O-6-alkylguanine-DNA:cysteine-protein methyltransferase  28.92 
 
 
171 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4477  AraC family transcriptional regulator  51.14 
 
 
350 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0696  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  41.46 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0115  ADA regulatory protein  48.86 
 
 
364 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000393468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0322  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  48.86 
 
 
364 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000161378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0132  ADA regulatory protein  48.86 
 
 
364 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0116  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  48.86 
 
 
364 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327978  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0849  ADA regulatory protein  30.43 
 
 
351 aa  89  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0950  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  32.45 
 
 
212 aa  88.6  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.267452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1451  O-6-alkylguanine-DNA:cysteine-protein methyltransferase  28.92 
 
 
171 aa  89  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1982  O-6-alkylguanine-DNA:cysteine-protein methyltransferase  28.92 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376159 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2300  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  48.86 
 
 
364 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000121844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2323  ADA regulatory protein  48.86 
 
 
364 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000161007  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01322  hypothetical protein  28.92 
 
 
171 aa  89  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2836  ADA regulatory protein  48.86 
 
 
364 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000994394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2249  ADA regulatory protein  48.86 
 
 
364 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000255362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0969  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  35.15 
 
 
193 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4054  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  37.04 
 
 
222 aa  88.2  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6508  bifunctional DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  41.53 
 
 
363 aa  88.2  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000013299  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3089  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 
363 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000381417  hitchhiker  0.0021619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0085  ADA regulatory protein  47.73 
 
 
364 aa  88.2  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3088  AraC family transcriptional regulator  47.73 
 
 
376 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000118536  hitchhiker  0.0000000000000798373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3205  AraC family transcriptional regulator  46.53 
 
 
380 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000040374  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2505  regulatory protein ada  47.13 
 
 
352 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  hitchhiker  0.000630655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2491  regulatory protein ada  47.13 
 
 
353 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2608  regulatory protein ada  47.13 
 
 
352 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.669578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2449  regulatory protein ada  47.13 
 
 
352 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0458356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4318  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  46.24 
 
 
380 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2401  regulatory protein ada  47.13 
 
 
352 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06470  O-6-methylguanine DNA methyltransferase  33.54 
 
 
214 aa  87.4  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1316  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  40.13 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0286  hypothetical protein  27.33 
 
 
352 aa  86.7  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0450605 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1576  O-6-alkylguanine-DNA:cysteine-protein methyltransferase  28.31 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3152  AraC family transcriptional regulator  46.53 
 
 
363 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000475647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2118  AraC family transcriptional regulator  47.19 
 
 
366 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0669009  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3171  AraC family transcriptional regulator  46.53 
 
 
363 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000719173  decreased coverage  0.000000135353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>