30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3084 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  99.53 
 
 		 2916 bp  5007    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  99.53 
 
 		 2916 bp  5007    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5122    99.46 
 
 		 2232 bp  4341    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.28474  normal  0.0365145 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  99.95 
 
 		 2301 bp  4320    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  100 
 
 		 744 bp  741    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3084    100 
 
 		 2557 bp  5069    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.827703  normal  0.713199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  99.57 
 
 		 2916 bp  5015    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  99.57 
 
 		 2916 bp  5015    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  99.53 
 
 		 2916 bp  5007    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2155    99.53 
 
 		 2742 bp  5007    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327212  normal  0.0658188 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  99.53 
 
 		 2916 bp  5007    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  99.28 
 
 		 2400 bp  2948    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  99.26 
 
 		 1902 bp  2890    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  99.53 
 
 		 2916 bp  5007    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  99.53 
 
 		 2916 bp  5007    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  99.53 
 
 		 2916 bp  5007    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6338    99.47 
 
 		 2430 bp  4440    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000307887  hitchhiker  0.0000155177 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  99.57 
 
 		 2916 bp  5015    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6455  hypothetical protein  100 
 
 		 354 bp  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  99.57 
 
 		 2916 bp  5015    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  99.57 
 
 		 2916 bp  5015    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6333    100 
 
 		 648 bp  577  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000551703  hitchhiker  0.000676151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  80.46 
 
 		 2913 bp  398  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0644    80.46 
 
 		 5236 bp  398  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129883 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  79.89 
 
 		 2841 bp  220  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  79.89 
 
 		 2910 bp  220  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  79.89 
 
 		 2910 bp  220  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  79.89 
 
 		 2910 bp  220  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  79.89 
 
 		 2841 bp  220  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  87.76 
 
 		 2538 bp  50.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>