20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6333 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  1267    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  99.84 
 
 		 2916 bp  1259    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  100 
 
 		 744 bp  1267    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  1267    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  1267    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  1267    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2155    100 
 
 		 2742 bp  918    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327212  normal  0.0658188 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  100 
 
 		 2916 bp  1267    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2400 bp  1267    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  1267    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 1902 bp  1267    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  100 
 
 		 2916 bp  1267    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  100 
 
 		 2916 bp  1267    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  100 
 
 		 2916 bp  1267    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6333    100 
 
 		 648 bp  1285    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000551703  hitchhiker  0.000676151 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  100 
 
 		 2916 bp  1267    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  100 
 
 		 2916 bp  1267    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3084    100 
 
 		 2557 bp  577  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.827703  normal  0.713199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1972    100 
 
 		 219 bp  365  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.448104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10660  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 1890 bp  48.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>