18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1972 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1972    100 
 
 		 219 bp  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.448104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2400 bp  365  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  100 
 
 		 744 bp  365  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 1902 bp  365  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6333    100 
 
 		 648 bp  365  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000551703  hitchhiker  0.000676151 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  100 
 
 		 2916 bp  365  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1973    100 
 
 		 958 bp  50.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.910712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>