69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0965 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0965  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 		 396 aa  827    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0855485  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2586  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  50.88 
 
 		 450 aa  421  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.88 
 
 		 450 aa  421  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2554  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  49.37 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2184  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.37 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0444039  hitchhiker  0.00000000677612 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0633  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.87 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0599243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.87 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0304768  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2100  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.13 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1081  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.14 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.87184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1546  hypothetical protein  50.89 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.018059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  29.47 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.18 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.3 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.25 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.13 
 
 		 293 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  25.17 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  26.13 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  26.13 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.13 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.03 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.17 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.93 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.88 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.62 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  23.27 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  25.52 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.88 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  23.45 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  22.84 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  28.27 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.71 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  24.81 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.97 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.81 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  22.84 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  23.83 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  24.05 
 
 		 301 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.03 
 
 		 462 aa  57  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.69 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  25.4 
 
 		 292 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  23.66 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  22.81 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.07 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  23.28 
 
 		 282 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.23 
 
 		 282 aa  53.1  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.52 
 
 		 282 aa  53.1  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  22.22 
 
 		 502 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.12 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.84 
 
 		 297 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  22.02 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  23.41 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  23.24 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.14 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  20.58 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1500  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  19.2 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.899863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.36 
 
 		 497 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  23.11 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.57 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  20.82 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  25.48 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  20.96 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.92 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1783  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  19.84 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  22.27 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  25.19 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  22.55 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.9 
 
 		 508 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  23.23 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.25 
 
 		 294 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.130606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>