56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2215 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  80.59 
 
 		 470 aa  776    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0304768  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2586  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  100 
 
 		 450 aa  948    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2554  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  91.69 
 
 		 447 aa  880    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 		 450 aa  948    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2184  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  91.69 
 
 		 447 aa  880    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0444039  hitchhiker  0.00000000677612 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0633  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  80.59 
 
 		 468 aa  773    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0599243 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1081  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.44 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.87184  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2100  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.13 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1546  hypothetical protein  50.77 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.018059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0965  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.88 
 
 		 396 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0855485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.76 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  27.83 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.28 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.77 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.74 
 
 		 300 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.68 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  25.25 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.62 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.47 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  22.49 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.18 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.01 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.26 
 
 		 300 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.15 
 
 		 282 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.45 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  23.45 
 
 		 293 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  21.43 
 
 		 308 aa  54.3  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  23.45 
 
 		 293 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  24.09 
 
 		 296 aa  53.5  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  26.5 
 
 		 282 aa  53.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  28.26 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  25.93 
 
 		 282 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.24 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  28.37 
 
 		 282 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  22.95 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  23.67 
 
 		 306 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.97 
 
 		 296 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.97 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  21.63 
 
 		 502 aa  50.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  20.07 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.53 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  23.55 
 
 		 292 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.77 
 
 		 508 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.65 
 
 		 294 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  21 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.64 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.33 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  24.36 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.35 
 
 		 301 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.38 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  21.88 
 
 		 296 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  25 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.45 
 
 		 288 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.08 
 
 		 291 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.82 
 
 		 304 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  24.53 
 
 		 285 aa  43.1  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>