117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1954 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  100 
 
 
314 aa  659    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.07 
 
 
300 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.39 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  28.8 
 
 
300 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.01 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.07 
 
 
307 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.01 
 
 
299 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  29.24 
 
 
293 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.24 
 
 
293 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  29.24 
 
 
293 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  28.9 
 
 
296 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  28.81 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.33 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.91 
 
 
296 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  27.12 
 
 
308 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.48 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.48 
 
 
348 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1546  hypothetical protein  28.21 
 
 
444 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.018059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2100  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.53 
 
 
437 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.95 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  27.54 
 
 
301 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0965  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.15 
 
 
396 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0855485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0633  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.92 
 
 
468 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0599243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.92 
 
 
470 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0304768  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  27.37 
 
 
306 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.83 
 
 
450 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2586  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  27.83 
 
 
450 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2184  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.96 
 
 
447 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0444039  hitchhiker  0.00000000677612 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2554  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  27.96 
 
 
447 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.56 
 
 
302 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.86 
 
 
282 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  26.23 
 
 
301 aa  96.3  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.55 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.86 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  24.01 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1081  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.75 
 
 
438 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.87184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  23.66 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.99 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.67 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  24.83 
 
 
282 aa  87.4  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.51 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.14 
 
 
282 aa  86.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.66 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  25.25 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.68 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  25.28 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.57 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  24.66 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.87 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  24.26 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.79 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.47 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.29 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.76 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.76 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.76 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.08 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  22.15 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  23.79 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.35 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  26.35 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.36 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  24.33 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.55 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.56 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  24.28 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.6 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.91 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  24.5 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  22.37 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.26 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.53 
 
 
497 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  22.85 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.05 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  22.74 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.04 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.58 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.11 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.02 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.37 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.91 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.43 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.01 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.64 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  25 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  22.02 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  23.02 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  23.02 
 
 
285 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.99 
 
 
294 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.11 
 
 
286 aa  62.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.02 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  20.86 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.36 
 
 
502 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.99 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.75 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  22.19 
 
 
349 aa  56.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>