64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1546 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1546  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  937    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.018059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2100  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  88.22 
 
 		 437 aa  832    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2586  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  50.77 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.77 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2184  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.39 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0444039  hitchhiker  0.00000000677612 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2554  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  50.39 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0633  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.13 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0599243 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1081  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.99 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.87184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.13 
 
 		 470 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0304768  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0965  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.89 
 
 		 396 aa  375  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0855485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  28.21 
 
 		 314 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.69 
 
 		 348 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  22.65 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.32 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.08 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  24.32 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.05 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  24.57 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.1 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.18 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  20.48 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  23.27 
 
 		 306 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.99 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.13 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  26 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.62 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  21.23 
 
 		 296 aa  57  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  24.14 
 
 		 301 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  21.76 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.21 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  24.27 
 
 		 285 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  23.53 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.6 
 
 		 293 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  21.6 
 
 		 293 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  21.6 
 
 		 293 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  24.03 
 
 		 282 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.86 
 
 		 282 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  23.85 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.1 
 
 		 301 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.36 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  24.59 
 
 		 282 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.14 
 
 		 282 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.89 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.48 
 
 		 502 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.48 
 
 		 293 aa  50.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.22 
 
 		 292 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.69 
 
 		 285 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.48 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  23.85 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  19.54 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.92 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.16 
 
 		 508 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  20.47 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  22.71 
 
 		 502 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  20.3 
 
 		 278 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  21.37 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.4 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.02 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  27.05 
 
 		 241 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  20.74 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.54 
 
 		 293 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  22.91 
 
 		 301 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.38 
 
 		 286 aa  43.5  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>