47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0633 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0633  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
468 aa  988    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0599243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  95.72 
 
 
470 aa  951    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0304768  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2586  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  80.59 
 
 
450 aa  773    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2554  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  82.38 
 
 
447 aa  782    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  80.59 
 
 
450 aa  773    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2184  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  82.38 
 
 
447 aa  782    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0444039  hitchhiker  0.00000000677612 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1081  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  56.1 
 
 
438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.87184  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2100  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.9 
 
 
437 aa  427  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1546  hypothetical protein  50.13 
 
 
444 aa  419  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.018059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0965  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.87 
 
 
396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0855485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.3 
 
 
348 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  28.92 
 
 
314 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.31 
 
 
482 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.42 
 
 
300 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.65 
 
 
297 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.61 
 
 
299 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.36 
 
 
497 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.57 
 
 
296 aa  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.27 
 
 
300 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  25.52 
 
 
300 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  24.09 
 
 
292 aa  50.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  26.58 
 
 
282 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.83 
 
 
282 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  20.43 
 
 
307 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.48 
 
 
295 aa  47.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.7 
 
 
282 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.14 
 
 
306 aa  47  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  19.13 
 
 
308 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.92 
 
 
462 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  20.18 
 
 
300 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  22.27 
 
 
296 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  27.23 
 
 
282 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.07 
 
 
282 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.3 
 
 
297 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  23.28 
 
 
502 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  20.78 
 
 
296 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  23.7 
 
 
296 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.4 
 
 
304 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.27 
 
 
293 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  24.53 
 
 
296 aa  44.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.05 
 
 
305 aa  44.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.38 
 
 
291 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  22.27 
 
 
293 aa  43.9  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.66 
 
 
508 aa  43.5  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  22.43 
 
 
296 aa  43.5  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  22.27 
 
 
293 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.7 
 
 
306 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>