38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2215 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0633  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  95.72 
 
 
468 aa  951    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0599243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2184  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  81.92 
 
 
447 aa  782    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0444039  hitchhiker  0.00000000677612 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  80.59 
 
 
450 aa  776    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2215  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
470 aa  990    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0304768  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2586  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  80.59 
 
 
450 aa  776    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2554  heterodisulfide reductase subunit B, homolog  81.92 
 
 
447 aa  782    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1081  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  56.1 
 
 
438 aa  451  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.87184  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2100  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.64 
 
 
437 aa  422  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1546  hypothetical protein  50.13 
 
 
444 aa  415  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.018059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0965  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  49.87 
 
 
396 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0855485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.3 
 
 
348 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  28.92 
 
 
314 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24 
 
 
482 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25 
 
 
300 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.48 
 
 
297 aa  57  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25 
 
 
497 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.57 
 
 
296 aa  51.2  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  25.11 
 
 
292 aa  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.2 
 
 
299 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.85 
 
 
300 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  25 
 
 
300 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.14 
 
 
306 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  20.77 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  20.35 
 
 
307 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.71 
 
 
293 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  19.23 
 
 
308 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.09 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  25.93 
 
 
282 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  23.28 
 
 
502 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  21.83 
 
 
296 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  22.71 
 
 
293 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  19.72 
 
 
300 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.95 
 
 
282 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  22.71 
 
 
293 aa  43.9  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.9 
 
 
282 aa  43.5  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.68 
 
 
282 aa  43.5  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  20.35 
 
 
296 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  22.75 
 
 
296 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>