124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0129 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  100 
 
 
282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  88.97 
 
 
282 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  85.82 
 
 
282 aa  508  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  85.46 
 
 
282 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  85.11 
 
 
282 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  82.27 
 
 
282 aa  496  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  81.56 
 
 
282 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  61.79 
 
 
282 aa  374  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  46.62 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  43.77 
 
 
296 aa  259  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  45.45 
 
 
293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  41.99 
 
 
297 aa  248  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.35 
 
 
302 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.05 
 
 
301 aa  222  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.07 
 
 
297 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  39.65 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  36.79 
 
 
295 aa  219  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  38.95 
 
 
301 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.77 
 
 
297 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  36.65 
 
 
285 aa  215  8e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  36.65 
 
 
285 aa  215  8e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.42 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.13 
 
 
300 aa  198  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  33.57 
 
 
299 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.19 
 
 
304 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  34.05 
 
 
285 aa  193  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  32.49 
 
 
290 aa  190  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.36 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.45 
 
 
290 aa  189  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.16 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.82 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.07 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  33.22 
 
 
293 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.22 
 
 
293 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  33.22 
 
 
293 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.86 
 
 
293 aa  169  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.88 
 
 
286 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.77 
 
 
285 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.16 
 
 
288 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.82 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  32.17 
 
 
300 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.58 
 
 
326 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.94 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  32.88 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  32.06 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.58 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.17 
 
 
299 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.47 
 
 
300 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  31.9 
 
 
281 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  31.82 
 
 
300 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.34 
 
 
302 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.03 
 
 
303 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.62 
 
 
283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.38 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  31.38 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.39 
 
 
462 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.34 
 
 
303 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  30.77 
 
 
349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  31.01 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.82 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.86 
 
 
300 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.86 
 
 
300 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.93 
 
 
293 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.21 
 
 
305 aa  149  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.54 
 
 
294 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.11 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.93 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.14 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.11 
 
 
295 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  29.75 
 
 
296 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  28.72 
 
 
299 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.21 
 
 
278 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.47 
 
 
296 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.96 
 
 
292 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  29.18 
 
 
308 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  30.96 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  32.12 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  32.64 
 
 
292 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.18 
 
 
281 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.72 
 
 
295 aa  139  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  31.32 
 
 
290 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.57 
 
 
296 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.1 
 
 
306 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  29.14 
 
 
502 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.14 
 
 
306 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.16 
 
 
296 aa  135  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.86 
 
 
502 aa  135  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.78 
 
 
508 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.57 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.42 
 
 
497 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.14 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.76 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.09 
 
 
317 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  29.03 
 
 
502 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.56 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.21 
 
 
282 aa  112  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  26.06 
 
 
281 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  24.66 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1184  Heterodisulfide reductase subunit B-like protein  23.4 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.910208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.22 
 
 
348 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>