More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0401 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0401  ribosomal protein L2  100 
 
 		 278 aa  553  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0309  50S ribosomal protein L2  70.5 
 
 		 278 aa  363  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237082 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 276 aa  362  4e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  65.45 
 
 		 276 aa  360  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  71.79 
 
 		 278 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  71.79 
 
 		 278 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  71.79 
 
 		 278 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  70.33 
 
 		 278 aa  356  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3920  50S ribosomal protein L2  70.44 
 
 		 279 aa  355  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  66.18 
 
 		 276 aa  355  5.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  69.71 
 
 		 278 aa  354  7.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  70.7 
 
 		 279 aa  353  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  71.69 
 
 		 277 aa  353  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3432  ribosomal protein L2  71.17 
 
 		 278 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4312  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 		 279 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  71.43 
 
 		 278 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  70.7 
 
 		 280 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 275 aa  352  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  69.85 
 
 		 277 aa  351  5.9999999999999994e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  63.27 
 
 		 277 aa  351  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3140  50S ribosomal protein L2  70.33 
 
 		 278 aa  351  8e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.524365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20840  50S ribosomal protein L2  68.5 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  64.1 
 
 		 275 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3755  ribosomal protein L2  70.33 
 
 		 278 aa  348  4e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2656  ribosomal protein L2  68.86 
 
 		 278 aa  348  7e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5127  ribosomal protein L2  70.63 
 
 		 279 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 		 276 aa  346  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  69.12 
 
 		 277 aa  345  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6611  50S ribosomal protein L2  69.96 
 
 		 277 aa  345  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  346  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  346  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  67.52 
 
 		 278 aa  345  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  345  7e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  344  8.999999999999999e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1188  50S ribosomal protein L2  68.61 
 
 		 279 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 276 aa  344  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  65.56 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  63.87 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  66.31 
 
 		 279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 276 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  69.34 
 
 		 278 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17130  50S ribosomal protein L2  68.98 
 
 		 279 aa  342  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.411927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0934  50S ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 275 aa  340  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 274 aa  338  8e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 275 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23780  50S ribosomal protein L2  68.86 
 
 		 278 aa  337  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6046  50S ribosomal protein L2  69.4 
 
 		 277 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1126  50S ribosomal protein L2  68.77 
 
 		 278 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.881325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0585  50S ribosomal protein L2  69.4 
 
 		 277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2972  50S ribosomal protein L2  68.61 
 
 		 279 aa  335  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.373119  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4504  ribosomal protein L2  67.63 
 
 		 277 aa  335  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  64.34 
 
 		 276 aa  334  1e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  60.43 
 
 		 278 aa  334  1e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2684  50S ribosomal protein L2  68.25 
 
 		 279 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.795972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  63 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 273 aa  332  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 277 aa  332  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 277 aa  332  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 275 aa  332  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04010  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 		 277 aa  331  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 277 aa  331  9e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1089  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 278 aa  331  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.062286 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  59.5 
 
 		 279 aa  330  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 275 aa  328  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  63.24 
 
 		 276 aa  328  6e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 281 aa  328  7e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 		 277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  59.86 
 
 		 279 aa  325  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  63.37 
 
 		 275 aa  324  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  58.97 
 
 		 280 aa  324  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  60.71 
 
 		 279 aa  323  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  60.66 
 
 		 274 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 276 aa  321  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  58.82 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 		 277 aa  319  3e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  63.74 
 
 		 276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  59.5 
 
 		 279 aa  319  3.9999999999999996e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 		 278 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  58.91 
 
 		 275 aa  318  6e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 275 aa  318  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  59.14 
 
 		 279 aa  318  7.999999999999999e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  59.34 
 
 		 273 aa  317  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  59.34 
 
 		 273 aa  317  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 		 274 aa  316  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  57.51 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 		 274 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>