More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4504 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4504  ribosomal protein L2  100 
 
 		 277 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6611  50S ribosomal protein L2  87 
 
 		 277 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0309  50S ribosomal protein L2  86.33 
 
 		 278 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  85.97 
 
 		 278 aa  457  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0585  50S ribosomal protein L2  87.36 
 
 		 277 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3755  ribosomal protein L2  84.48 
 
 		 278 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  85.25 
 
 		 278 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1126  50S ribosomal protein L2  87.36 
 
 		 278 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.881325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  83.45 
 
 		 279 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  83.87 
 
 		 279 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2656  ribosomal protein L2  84.17 
 
 		 278 aa  448  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6046  50S ribosomal protein L2  86.62 
 
 		 277 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3140  50S ribosomal protein L2  84.89 
 
 		 278 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.524365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  84.17 
 
 		 278 aa  444  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17130  50S ribosomal protein L2  82.73 
 
 		 279 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.411927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0934  50S ribosomal protein L2  83.81 
 
 		 278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  84.53 
 
 		 278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20840  50S ribosomal protein L2  84.17 
 
 		 278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  83.03 
 
 		 278 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04010  50S ribosomal protein L2  85.56 
 
 		 277 aa  441  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  83.45 
 
 		 278 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3920  50S ribosomal protein L2  81.29 
 
 		 279 aa  441  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  83.45 
 
 		 278 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  83.45 
 
 		 278 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3432  ribosomal protein L2  82.31 
 
 		 278 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4312  50S ribosomal protein L2  80.58 
 
 		 279 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  81.59 
 
 		 280 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  83.81 
 
 		 277 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2684  50S ribosomal protein L2  82.37 
 
 		 279 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.795972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2972  50S ribosomal protein L2  82.01 
 
 		 279 aa  434  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.373119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1188  50S ribosomal protein L2  82.01 
 
 		 279 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1089  50S ribosomal protein L2  81.04 
 
 		 278 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.062286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23780  50S ribosomal protein L2  83.09 
 
 		 278 aa  431  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5127  ribosomal protein L2  81.41 
 
 		 279 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  79.42 
 
 		 277 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  77.26 
 
 		 277 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  71.94 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  71.58 
 
 		 276 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  63.67 
 
 		 277 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  65.83 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  66.3 
 
 		 276 aa  358  6e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 276 aa  357  9e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  64.86 
 
 		 276 aa  355  2.9999999999999997e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 275 aa  343  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 		 275 aa  343  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  62.59 
 
 		 275 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 275 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  64 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  63.21 
 
 		 279 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  339  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  338  5e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 275 aa  332  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  63.37 
 
 		 274 aa  331  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 276 aa  330  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  329  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  329  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0401  ribosomal protein L2  68.03 
 
 		 278 aa  328  7e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  59.43 
 
 		 280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  58.55 
 
 		 283 aa  326  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 		 274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 276 aa  326  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 273 aa  326  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 		 274 aa  324  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  63.1 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  60.73 
 
 		 275 aa  323  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 276 aa  323  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  58.76 
 
 		 275 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  60.43 
 
 		 278 aa  322  5e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 277 aa  321  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 		 274 aa  321  8e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 277 aa  320  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 277 aa  320  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  61.17 
 
 		 274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  61.17 
 
 		 274 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  59.84 
 
 		 277 aa  318  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 		 275 aa  318  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  58.97 
 
 		 274 aa  318  6e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 282 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 		 274 aa  315  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  60.79 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 282 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  59.21 
 
 		 276 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 277 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>