87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4357 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4357  spoIIIJ-associated protein  100 
 
 		 169 aa  327  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4513  spoIIIJ-associated protein  94.05 
 
 		 169 aa  290  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4494  spoIIIJ-associated protein  93.45 
 
 		 169 aa  285  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4505  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  70.86 
 
 		 168 aa  204  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518738  normal  0.712691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3325  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  33.57 
 
 		 206 aa  84.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0161391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2148  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  36.36 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2234  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  34.27 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3942  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  31.29 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2670  SpoIIIJ-associated protein  28.28 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2993  R3H domain-containing protein  26.9 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23570  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  32.19 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.10216  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0706  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0014097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2138  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.91 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.101522 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1108  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.61 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00153478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6896  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  31.29 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2393  single-stranded nucleic acid binding R3H  36.84 
 
 		 437 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3158  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.35 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.878334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4366  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  34.41 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3964  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  31.65 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731182  normal  0.0938919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2946  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.86 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000137296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1428  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  31.45 
 
 		 229 aa  62  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.436492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3487  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.57 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1423  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  36 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2598  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  30.69 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0763  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  29.21 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.238537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0887  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.49 
 
 		 498 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00650736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1916  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  34.44 
 
 		 430 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224043  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2366  single-stranded nucleic acid binding R3H  27.34 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0103  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  29.01 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1197  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  32.29 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000457064  hitchhiker  0.000925706 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2520  single-stranded nucleic acid binding R3H  30.07 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.885926  hitchhiker  0.000525149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2410  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  27.61 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000733307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4958  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  37.76 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000279065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0069  single-stranded nucleic acid binding R3H  30.22 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3113  single-stranded nucleic acid binding R3H  30.43 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167543  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1966  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.53 
 
 		 455 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.452949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4981  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  34.02 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3120  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.79 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000729653  hitchhiker  0.0000000587752 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14170  predicted RNA-binding protein  27.66 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28510  predicted RNA-binding protein  33.68 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00371448  hitchhiker  0.001116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3212  single-stranded nucleic acid binding R3H  33.68 
 
 		 228 aa  51.6  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3559  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.78 
 
 		 218 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31940  predicted RNA-binding protein  32.99 
 
 		 232 aa  51.2  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1365  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.78 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.856474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1941  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  29.47 
 
 		 255 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000134575  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0607  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  30.61 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000089602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2573  single-stranded nucleic acid binding R3H  24.65 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9386  spoIIIJ-associated protein  31.25 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2931  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.06 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000538907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27000  predicted RNA-binding protein  35.64 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3592  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  30.07 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4864  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.43 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0104759  hitchhiker  0.00517624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1536  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.15 
 
 		 203 aa  48.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5278  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  26.76 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4025  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  25 
 
 		 205 aa  47.8  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5182  Jag protein (SpoIIIJ-associated protein)  27.78 
 
 		 205 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0241441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5166  jag protein (SpoIIIJ-associated protein)  27.78 
 
 		 205 aa  47.4  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5338  jag protein  27.78 
 
 		 205 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5595  jag protein  27.78 
 
 		 205 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5735  jag protein  27.78 
 
 		 205 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3933  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  34.04 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000105955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5636  jag protein  29.03 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0216  single-stranded nucleic acid binding R3H  29.66 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.154539  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5946  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.39 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3430  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.03 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5612  jag protein  24.5 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.619797  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2034  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.86 
 
 		 281 aa  45.1  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3436  single-stranded nucleic acid binding R3H  28 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.948482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5672  jag protein  27.08 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4696  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  28.77 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4168  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  32.98 
 
 		 188 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5323  jag protein  23.68 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.122987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4711  single-stranded nucleic acid binding R3H  30.61 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.939144 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0118  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  25.17 
 
 		 207 aa  44.7  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0893  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  25.16 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4239  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.73 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1788  DNA/RNA-binding protein  24.82 
 
 		 349 aa  43.9  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000347155  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2395  Jag protein, putative  30.14 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4098  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.39 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4059  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.39 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5264  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  24.36 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.0656004 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2759  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  30.21 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000230158  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1039  SpoIIIJ-associated protein Jag, putative  28.76 
 
 		 226 aa  42  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00710769  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_909  RNA-binding protein  36.49 
 
 		 226 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000072438  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1037  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  23.45 
 
 		 226 aa  41.6  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.220357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3375  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  26.19 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0130  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  24.07 
 
 		 204 aa  41.2  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>