21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2100 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  915    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3472  hypothetical protein  64.95 
 
 		 368 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.39471  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  37.36 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  36.73 
 
 		 455 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  36.9 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  31.73 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  29.86 
 
 		 485 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  29.86 
 
 		 485 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  29.89 
 
 		 468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  31.49 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  31.49 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  32.98 
 
 		 552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  29.24 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  29.73 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  26.49 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  30.89 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  51.92 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0434  hypothetical protein  42.42 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  0.0528043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3283  hypothetical protein  38 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000174238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3353  hypothetical protein  43.18 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000199743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0892  hypothetical protein  40.91 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.81771e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>