19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1428 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  100 
 
 		 482 aa  994    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  100 
 
 		 482 aa  994    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  62.81 
 
 		 485 aa  587  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  62.81 
 
 		 485 aa  587  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  35.19 
 
 		 446 aa  203  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  33.61 
 
 		 446 aa  193  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  31.57 
 
 		 450 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  31.07 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  30.08 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3472  hypothetical protein  33.95 
 
 		 368 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.39471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  28.54 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  29.85 
 
 		 445 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  30.06 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  28.21 
 
 		 552 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  25.71 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  31.48 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  29.93 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3283  hypothetical protein  33.85 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000174238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0434  hypothetical protein  31.25 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  0.0528043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>