17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0434 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0434  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  945    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  0.0528043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  41.1 
 
 
446 aa  53.9  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  37.33 
 
 
446 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3283  hypothetical protein  40 
 
 
450 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000174238  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  41.54 
 
 
493 aa  51.6  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0892  hypothetical protein  35.38 
 
 
443 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.81771e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1062  cytochrome c, putative  54.05 
 
 
241 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3353  hypothetical protein  37.7 
 
 
443 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000199743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  39.19 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  41.43 
 
 
455 aa  48.5  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  34.12 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0733  cytochrome c, putative  48.78 
 
 
231 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00642674  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  31.25 
 
 
482 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  31.25 
 
 
482 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  33.33 
 
 
485 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  33.33 
 
 
485 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  41.46 
 
 
450 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>