19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0618 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  100 
 
 
455 aa  932    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  39.07 
 
 
446 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  38.76 
 
 
446 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  35.52 
 
 
468 aa  261  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  36.85 
 
 
449 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3472  hypothetical protein  35.89 
 
 
368 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.39471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  32 
 
 
450 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  31.18 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  30.73 
 
 
446 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  32.27 
 
 
552 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  29.28 
 
 
485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  29.28 
 
 
485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  30.08 
 
 
482 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  30.08 
 
 
482 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  27.68 
 
 
475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  24.47 
 
 
493 aa  64.7  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  33.33 
 
 
421 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0434  hypothetical protein  41.43 
 
 
459 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  0.0528043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3283  hypothetical protein  37.1 
 
 
450 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000174238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>