15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3472 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3472  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  748    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.39471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  64.95 
 
 		 449 aa  511  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  35.89 
 
 		 455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  37.57 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  37.84 
 
 		 446 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  31.84 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  30.88 
 
 		 552 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  30.87 
 
 		 485 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  30.87 
 
 		 485 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  33.95 
 
 		 482 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  33.95 
 
 		 482 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  29.33 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  27.08 
 
 		 475 aa  92.8  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  27.61 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  27.27 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>