22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1778 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  75.06 
 
 		 446 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  100 
 
 		 446 aa  916    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  41.85 
 
 		 450 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  41.74 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  38.76 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  37.04 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  35.01 
 
 		 475 aa  216  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3472  hypothetical protein  37.57 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.39471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  33.33 
 
 		 468 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  34.14 
 
 		 485 aa  189  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  34.14 
 
 		 485 aa  189  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  35.19 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  35.19 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  34.66 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  30.11 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  23.34 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  49.15 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0434  hypothetical protein  37.33 
 
 		 459 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  0.0528043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3445  hypothetical protein  45 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00254037  normal  0.641592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3353  hypothetical protein  38.89 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000199743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1062  cytochrome c, putative  40.32 
 
 		 241 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3283  hypothetical protein  33.9 
 
 		 450 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000174238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>