19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1583 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  100 
 
 
468 aa  962    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  35.52 
 
 
455 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  36.3 
 
 
450 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  34.38 
 
 
446 aa  216  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  33.33 
 
 
446 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  33.18 
 
 
446 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  33.77 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  29.59 
 
 
449 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  28.6 
 
 
475 aa  152  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  29.16 
 
 
552 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  28.74 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  28.74 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  28.71 
 
 
485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  28.71 
 
 
485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3472  hypothetical protein  29.16 
 
 
368 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.39471  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  22.72 
 
 
493 aa  60.8  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  33.59 
 
 
421 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0892  hypothetical protein  35.06 
 
 
443 aa  46.6  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.81771e-31 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0434  hypothetical protein  26.9 
 
 
459 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  0.0528043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>