17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00209 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  100 
 
 		 446 aa  907    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  32.96 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  30.73 
 
 		 455 aa  179  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  32.02 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  30.07 
 
 		 446 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  28.06 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  31.56 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  26.54 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  25.93 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  25.93 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  25.66 
 
 		 449 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  25 
 
 		 552 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  25.83 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  25.83 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3472  hypothetical protein  27.27 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.39471  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  54.35 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  33.85 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>