17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3615 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1119    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  34.66 
 
 		 446 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  32.75 
 
 		 450 aa  167  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  32.27 
 
 		 455 aa  160  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  35.04 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  32.98 
 
 		 449 aa  154  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3472  hypothetical protein  30.88 
 
 		 368 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.39471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  29.16 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  28.26 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  29.66 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  29.66 
 
 		 485 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  27.64 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  27.64 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  25 
 
 		 446 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  27.47 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  50.88 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  46.3 
 
 		 421 aa  47  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>