20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0914 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  100 
 
 		 445 aa  914    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  41.74 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  40.86 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  35.98 
 
 		 450 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  38.03 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  33.77 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  31.18 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  28.57 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  27.93 
 
 		 485 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  27.93 
 
 		 485 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  29.14 
 
 		 482 aa  123  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  29.14 
 
 		 482 aa  123  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  28.26 
 
 		 552 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  31.97 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3472  hypothetical protein  27.61 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.39471  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  23.62 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  41.67 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3283  hypothetical protein  26.14 
 
 		 450 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3445  hypothetical protein  46.34 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00254037  normal  0.641592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3353  hypothetical protein  40.82 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000199743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>