17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0545 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0545  putative cytochrome c1 signal peptide protein  100 
 
 		 475 aa  969    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  38.03 
 
 		 445 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  35.01 
 
 		 446 aa  216  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  32.22 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  32.64 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  28.4 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  27.68 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  28.46 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  28.46 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2100  hypothetical protein  29.51 
 
 		 449 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  29.21 
 
 		 482 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  29.21 
 
 		 482 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3472  hypothetical protein  27.08 
 
 		 368 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.39471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00209  cytochrome C  26.54 
 
 		 446 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3615  hypothetical protein  27.47 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  35.04 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  23.24 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>