16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3283 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3283  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  929    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000174238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3353  hypothetical protein  45.71 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000199743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0892  hypothetical protein  45.96 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.81771e-31 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3445  hypothetical protein  22.88 
 
 		 385 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00254037  normal  0.641592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0434  hypothetical protein  30.17 
 
 		 459 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  0.0528043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  42.59 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0733  cytochrome c, putative  34.44 
 
 		 231 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00642674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1062  cytochrome c, putative  38.89 
 
 		 241 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  26.14 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  47.37 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0618  putative cytochrome c1 signal peptide protein  36.62 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84464  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  33.85 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  37.25 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  33.85 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  37.25 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  33.9 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>