20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3445 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3445  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  771    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00254037  normal  0.641592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0892  hypothetical protein  26.6 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.81771e-31 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1442  hypothetical protein  33.58 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3353  hypothetical protein  24.69 
 
 
443 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000199743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3283  hypothetical protein  24.27 
 
 
450 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000174238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3153  cytochrome c  28.57 
 
 
485 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2751  cytochrome c  28.57 
 
 
485 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0647826  hitchhiker  0.00000636935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0319  hypothetical protein  41.27 
 
 
493 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000684718  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1778  cytochrome c  43.55 
 
 
446 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1062  cytochrome c, putative  44.83 
 
 
241 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0914  putative cytochrome c1 signal peptide protein  45.83 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1145  cytochrome c  21.72 
 
 
482 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1428  cytochrome c  21.72 
 
 
482 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0196  putative cytochrome c1 signal peptide protein  40 
 
 
446 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0434  hypothetical protein  25.3 
 
 
459 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  0.0528043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4123  phosphate-selective porin O and P  44.44 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2289  cytochrome c1 precursor protein  27.46 
 
 
450 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130595  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4007  hypothetical protein  42.86 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4149  phosphate-selective porin O and P  42.86 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1583  cytochrome c1 precursor protein  37.88 
 
 
468 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0727125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>