33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_4388 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4388  OstA family protein  100 
 
 
165 aa  336  8e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1639  hypothetical protein  76.97 
 
 
165 aa  244  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44073  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2273  OstA-like protein  54.49 
 
 
172 aa  154  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2167  OstA family protein  51.39 
 
 
173 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15124  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2120  OstA family protein  51.39 
 
 
173 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3750  OstA family protein  55.81 
 
 
162 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2506  OstA family protein  58.59 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.979072  normal  0.875661 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0514  hypothetical protein  58.25 
 
 
140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.488743  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16781  hypothetical protein  42.59 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.353527 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1245  hypothetical protein  45.19 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1234  hypothetical protein  40.22 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.76 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  25.76 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.76 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.76 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.76 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.76 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.76 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.76 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.76 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.26 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.26 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.26 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.26 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.26 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  26.24 
 
 
791 aa  45.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  27.62 
 
 
792 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  27.62 
 
 
792 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  28.3 
 
 
786 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.09 
 
 
182 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  40.98 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5033  OstA family protein  29.73 
 
 
833 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.589653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>