15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2273 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2273  OstA-like protein  100 
 
 
172 aa  344  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3750  OstA family protein  61.87 
 
 
162 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2120  OstA family protein  70.19 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2167  OstA family protein  70.19 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15124  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1639  hypothetical protein  63.33 
 
 
165 aa  143  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44073  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0514  hypothetical protein  60.16 
 
 
140 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.488743  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2506  OstA family protein  73.91 
 
 
164 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.979072  normal  0.875661 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4388  OstA family protein  54.49 
 
 
165 aa  132  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16781  hypothetical protein  53.85 
 
 
128 aa  95.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.353527 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1245  hypothetical protein  41.73 
 
 
145 aa  92.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1234  hypothetical protein  45.65 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  38.1 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  39.29 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.62 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  29.25 
 
 
169 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>