17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1234 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1234  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1245  hypothetical protein  58.97 
 
 
145 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16781  hypothetical protein  52.83 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.353527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3750  OstA family protein  40.54 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2506  OstA family protein  41.44 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.979072  normal  0.875661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2167  OstA family protein  38.05 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15124  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2120  OstA family protein  38.05 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1639  hypothetical protein  37.7 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44073  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2273  OstA-like protein  45.65 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0514  hypothetical protein  39.77 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.488743  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4388  OstA family protein  40.22 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  34.72 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  31.88 
 
 
791 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  42.03 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  32.65 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  36.11 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 
686 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>