19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1245 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1245  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1234  hypothetical protein  58.97 
 
 
127 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16781  hypothetical protein  61.22 
 
 
128 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.353527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3750  OstA family protein  52 
 
 
162 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2506  OstA family protein  50.48 
 
 
164 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.979072  normal  0.875661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2167  OstA family protein  46.23 
 
 
173 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15124  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2120  OstA family protein  46.23 
 
 
173 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2273  OstA-like protein  41.73 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0514  hypothetical protein  48.94 
 
 
140 aa  91.3  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.488743  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1639  hypothetical protein  45.28 
 
 
165 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44073  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4388  OstA family protein  45.19 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  35.16 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  32.71 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  28.92 
 
 
777 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  32.05 
 
 
686 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  26.73 
 
 
792 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  32.26 
 
 
697 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  26.73 
 
 
792 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  30.12 
 
 
781 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.169469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>