18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2506 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2506  OstA family protein  100 
 
 
164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.979072  normal  0.875661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3750  OstA family protein  57.04 
 
 
162 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2167  OstA family protein  50.34 
 
 
173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15124  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2120  OstA family protein  50.34 
 
 
173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2273  OstA-like protein  73.91 
 
 
172 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1639  hypothetical protein  64.55 
 
 
165 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44073  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0514  hypothetical protein  70.83 
 
 
140 aa  137  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.488743  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4388  OstA family protein  61.34 
 
 
165 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1245  hypothetical protein  50.48 
 
 
145 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16781  hypothetical protein  51.55 
 
 
128 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.353527 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1234  hypothetical protein  41.44 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  28.57 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  35.64 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.95 
 
 
182 aa  50.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0743  OstA family protein  25 
 
 
435 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.8238399999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  29.52 
 
 
181 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0753  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.26 
 
 
194 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  27.1 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>