130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1482 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1197  globin  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270568 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1482  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1477  hypothetical protein  30.07 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104844 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0993  globin  26.77 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  32.82 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  33.33 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  32.06 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  30.71 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  30 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  33.33 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  31.9 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  38.89 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  38.89 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  29.31 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  30.89 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  34.51 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  32.48 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  33.86 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  28.33 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  30.17 
 
 		 127 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  29.27 
 
 		 132 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  29.27 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  34.51 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  36.89 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  35.45 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  35.45 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  35.45 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  31.03 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  32.48 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  29.27 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  29.27 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  29.27 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  29.27 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  29.91 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  34.51 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  34.51 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  29.91 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  29.27 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  29.27 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  29.27 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  29.06 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  30 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  28.46 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  32.29 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  31.11 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  34.62 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  35.58 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  35.58 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  35.58 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  35.58 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  33.61 
 
 		 127 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  32.69 
 
 		 129 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  32.69 
 
 		 130 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  39.47 
 
 		 125 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  26.52 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  34.95 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  34.29 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  32.8 
 
 		 135 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  32.38 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1989  globin  28.68 
 
 		 136 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  34.62 
 
 		 136 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  34.62 
 
 		 136 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  31.54 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  30.17 
 
 		 137 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  34.02 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  33.33 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  33.96 
 
 		 137 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  30.25 
 
 		 141 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  28.81 
 
 		 129 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  28.95 
 
 		 141 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  31.3 
 
 		 137 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  32.33 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  28.21 
 
 		 137 aa  52  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  33.33 
 
 		 145 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  29.66 
 
 		 131 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  31.87 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  36.19 
 
 		 129 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  32.88 
 
 		 125 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  34.12 
 
 		 137 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  33.33 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  31.37 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  50 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  33.33 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  29.47 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  33.71 
 
 		 136 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  36.11 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  24.17 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  31.87 
 
 		 136 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  47.83 
 
 		 134 aa  48.5  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  51.28 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  34.02 
 
 		 142 aa  48.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  24.65 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  40.82 
 
 		 129 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  34.52 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  34.52 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  33.73 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  34.52 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.404542 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>