63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0993 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0993  globin  100 
 
 
153 aa  314  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1482  hypothetical protein  26.77 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1197  globin  26.77 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  26.92 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  31.4 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  29.51 
 
 
357 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  28.8 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  26.15 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  24.6 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  26.98 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  24.82 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  28.57 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  28.57 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  27.56 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1989  globin  23.91 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  26.36 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  26.67 
 
 
127 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  24.63 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  27.56 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  26.24 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  26.4 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  23.26 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  25.98 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  24.39 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  23.78 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  25.83 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  24 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  25.41 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  26.77 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  25.58 
 
 
132 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  28.36 
 
 
131 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  25.58 
 
 
132 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  28.36 
 
 
131 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  28.36 
 
 
131 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  24.59 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  26.15 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  24.48 
 
 
173 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  27.56 
 
 
125 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  27.13 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  24.8 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  28.81 
 
 
139 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  25.58 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  25.2 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  26.27 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  23.77 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  25.98 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  24.81 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  24.81 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  24.81 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  24.81 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  24.81 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  24.81 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  24.81 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  23.33 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  25.2 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  23.33 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  25.86 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  22.13 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  38.46 
 
 
125 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  24.17 
 
 
188 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  24.8 
 
 
123 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  27.56 
 
 
129 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1477  hypothetical protein  18.25 
 
 
209 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>