22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0094 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  56.38 
 
 		 199 aa  208  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  50.78 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  48.9 
 
 		 209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  41.18 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  40.86 
 
 		 215 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  37.22 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  37.22 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  37.22 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  35.52 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  29.09 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  27.44 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  29.93 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  30.53 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  21.52 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2115  DNA polymerase beta subunit  27.46 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  29.67 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  41.1 
 
 		 112 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2688  hypothetical protein  28.45 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>