29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0023 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  682    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  50.77 
 
 		 331 aa  339  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  51.27 
 
 		 330 aa  330  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  45.67 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  45.9 
 
 		 337 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  45.9 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  45.9 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  45.9 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  45.9 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  45.12 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  45.37 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  43.64 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  41.52 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  42.45 
 
 		 340 aa  262  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  38.46 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  41.95 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  41.94 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  40 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  39.87 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  36.04 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  34.43 
 
 		 340 aa  198  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  33.13 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  32.28 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  32.73 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  29.79 
 
 		 337 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  31.45 
 
 		 344 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  30.42 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  46.43 
 
 		 371 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  27.46 
 
 		 416 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>