56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2907 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  901    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  98.62 
 
 
434 aa  892    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  38.98 
 
 
232 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  47.24 
 
 
227 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  45.68 
 
 
322 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 
402 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  38.05 
 
 
382 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  38.51 
 
 
282 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  36.09 
 
 
281 aa  123  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  37.5 
 
 
218 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  29.14 
 
 
257 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1527  hypothetical protein  28.65 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  30.51 
 
 
257 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14461  hypothetical protein  26.32 
 
 
241 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.09 
 
 
273 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  28.4 
 
 
276 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  27.66 
 
 
230 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  29.01 
 
 
268 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  30.07 
 
 
316 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2025  hypothetical protein  29.65 
 
 
236 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0551  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  23.49 
 
 
224 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  29.38 
 
 
301 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2351  macrocin-O-methyltransferase  31.03 
 
 
557 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  23.49 
 
 
224 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0529  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  23.49 
 
 
224 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3930  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.72 
 
 
236 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  28.11 
 
 
250 aa  50.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  23.37 
 
 
268 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.97 
 
 
222 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3751  hypothetical protein  28.12 
 
 
259 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.21 
 
 
251 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3359  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.37 
 
 
246 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  26.06 
 
 
291 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  30.71 
 
 
265 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0740  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
158 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.773618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  29.5 
 
 
213 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  24.32 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  27.14 
 
 
250 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
927 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
968 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
1770 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  25 
 
 
485 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.97 
 
 
240 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3035  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.23 
 
 
882 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0641  hypothetical protein  28.68 
 
 
286 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
217 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.75 
 
 
196 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  24.57 
 
 
1013 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4591  methyltransferase  22.78 
 
 
158 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 
878 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.71 
 
 
810 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0930  macrocin-O-methyltransferase  27.66 
 
 
281 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.5 
 
 
585 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2182  macrocin-O-methyltransferase  26.5 
 
 
166 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.321151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>