79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0125 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0125  putative conjugal transfer protein TrbN  100 
 
 		 159 aa  329  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.268051  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4262  conjugal transfer protein TrbN  45.45 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457278 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6623  conjugal transfer protein TrbN  45.45 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6514  conjugal transfer protein TrbN  45.45 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224309  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0057  conjugal transfer protein TrbN  46.38 
 
 		 206 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2236  conjugal transfer protein TrbN  45.04 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1434  conjugal transfer protein TrbN  45.04 
 
 		 201 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0060  hypothetical protein  39.34 
 
 		 187 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816784 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4262  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  32.81 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  33.6 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  33.08 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  35.34 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  35.34 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  35.34 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0011  conjugal transfer protein  32.69 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  35.34 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  35.34 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  35.34 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1529  Lytic transglycosylase catalytic  31.5 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.425819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  35.16 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  33.07 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  31.25 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3138  Lytic transglycosylase catalytic  29.77 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.82617  normal  0.443685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5437  lytic transglycosylase, catalytic  32.06 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43825  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2772  Lytic transglycosylase catalytic  30.4 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  29.32 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  29.32 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  29.32 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  29.32 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  29.32 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  29.32 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  33.86 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  29.32 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4183  lytic transglycosylase, catalytic  34.43 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158148  normal  0.513979 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  31.47 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  33.07 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  33.07 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  31.47 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0882  lytic transglycosylase, catalytic  28.12 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  31.65 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5233  lytic transglycosylase, catalytic  30.95 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00145184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05356  putative lipoprotein  31.86 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.592846  normal  0.453874 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  31.5 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 407 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  31.5 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  32.48 
 
 		 404 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 599 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  35.25 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 404 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 408 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 408 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.06 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 438 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  31.93 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  31.62 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3682  lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.325069 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5666  lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326026  hitchhiker  0.0069947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  31.93 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  31.09 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1065  conjugal transfer protein, putative  26.04 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  33.88 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  32.76 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  33.06 
 
 		 239 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5883  lytic transglycosylase, catalytic  30.88 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.161206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  30.7 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  29.91 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  31.19 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  27.27 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  31.19 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>