34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3699 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  73.53 
 
 		 521 aa  809    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1046    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  46.03 
 
 		 507 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  45.53 
 
 		 512 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  45.96 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  39.53 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  39.19 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  40.28 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  39.29 
 
 		 504 aa  405  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  40.08 
 
 		 505 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  40.08 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  42 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  39.8 
 
 		 505 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  38.19 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  39.71 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  40.13 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  40.12 
 
 		 506 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  39.84 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  39.07 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  39.71 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  38.84 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  38.68 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  38.54 
 
 		 521 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  36.51 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  36.51 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  37.13 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  37.18 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  44.28 
 
 		 209 aa  206  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  27.08 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  26.97 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  22.29 
 
 		 544 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  23.93 
 
 		 522 aa  90.1  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  21.67 
 
 		 517 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  21.67 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>