236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3501 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  100 
 
 		 422 aa  874    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  98.35 
 
 		 424 aa  863    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  99.29 
 
 		 422 aa  867    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  78.22 
 
 		 373 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  63.79 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  63.79 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  63.79 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  63.79 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  63.51 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  63.51 
 
 		 357 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  63.51 
 
 		 357 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  63.51 
 
 		 357 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  63.51 
 
 		 357 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  64.78 
 
 		 356 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  64.48 
 
 		 357 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  64.48 
 
 		 364 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  64.48 
 
 		 364 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  64.18 
 
 		 357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  64.48 
 
 		 364 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  42.72 
 
 		 638 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  43.23 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  43.62 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  43.27 
 
 		 344 aa  230  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  43.19 
 
 		 335 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  44.57 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  40.71 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  38.72 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  38.98 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  37.99 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  38.36 
 
 		 383 aa  209  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  38.49 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  37.31 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  37.09 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  35.21 
 
 		 282 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  32.37 
 
 		 381 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  34.95 
 
 		 290 aa  170  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  35.97 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  35.64 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  35.23 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  41.54 
 
 		 383 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  43.68 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  26.77 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  29.11 
 
 		 289 aa  96.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  28.33 
 
 		 281 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  28.67 
 
 		 284 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  26.32 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  26.67 
 
 		 283 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  26.32 
 
 		 283 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  26.87 
 
 		 293 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  26.32 
 
 		 283 aa  90.1  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  26.32 
 
 		 283 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  25.26 
 
 		 283 aa  90.1  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  32.45 
 
 		 281 aa  89.7  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  25.96 
 
 		 283 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  26.53 
 
 		 293 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  27.27 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  26.32 
 
 		 283 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  26.64 
 
 		 293 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  27.27 
 
 		 284 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  27.27 
 
 		 284 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  27.27 
 
 		 284 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  27.27 
 
 		 284 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  27.27 
 
 		 284 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  27.08 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  26.57 
 
 		 284 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  27.78 
 
 		 283 aa  87.4  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  26.53 
 
 		 293 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  26.92 
 
 		 284 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  26.92 
 
 		 284 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  27.84 
 
 		 290 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  27.4 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  27.84 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  28.46 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  27.84 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  25.87 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  27.04 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  26.48 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  27.4 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  25.67 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  32.95 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  23.13 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  23.13 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  25.51 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.53 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  25.1 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  28.04 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.64 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  27.14 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  28.57 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  26.76 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  27.88 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  26.74 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  25.18 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  25.62 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  25.98 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  25.61 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  22.92 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  25.1 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  31.05 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  26.84 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>