20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0831 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  97.06 
 
 
204 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  48.69 
 
 
199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  54.55 
 
 
190 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  40.77 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  47.15 
 
 
217 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  39.67 
 
 
165 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  27.69 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  29.25 
 
 
170 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  24.17 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.33 
 
 
421 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  30.95 
 
 
176 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  27.5 
 
 
176 aa  45.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  35.42 
 
 
692 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  37.93 
 
 
672 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  37.25 
 
 
667 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  26.13 
 
 
669 aa  41.6  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  23.44 
 
 
218 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  27.38 
 
 
148 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>