22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3424 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013531  Xcel_3424  TadE family protein  100 
 
 
141 aa  275  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  54.17 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  48.15 
 
 
152 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4452  TadE family protein  40.67 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4965  TadE family protein  41.33 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0676  TadE family protein  49.63 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  39.44 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  35.71 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1228  TadE family protein  41.04 
 
 
144 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  37.41 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  31.58 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  37.59 
 
 
163 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6889  TadE family protein  38.73 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  0.715699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3329  hypothetical protein  31.11 
 
 
367 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  38.52 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2342  TadE family protein  40 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  41.79 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  39.66 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10370  hypothetical protein  36.3 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129206  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3423  TadE family protein  35.82 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  35.82 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  33.82 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>