26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2876 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  47.89 
 
 
283 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  39.04 
 
 
303 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  35.32 
 
 
310 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  34.48 
 
 
307 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  33.09 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  31.83 
 
 
312 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  32.62 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  32.35 
 
 
312 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  32.37 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  37.12 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  34.86 
 
 
303 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  31.75 
 
 
305 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  35.2 
 
 
281 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  34.8 
 
 
293 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  38.07 
 
 
281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  35.92 
 
 
230 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  32.99 
 
 
278 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  30.08 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  39.24 
 
 
251 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  35.65 
 
 
289 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  32.08 
 
 
289 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  25.74 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25040  protein of unknown function (DUF1814)  27.64 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  30.81 
 
 
299 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  29.44 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>